De Franz John a Karl Hopfner, la lista de presidentes del Bayern en más de 110 años de historia es extensa e ilustre. El miembro fundador John ocupó el cargo entre 1900 y 1903, mientras que Karl Hopfner fue elegido en 2014. Un total de 30 presidentes entre los que destaca Kurt Landauer, quien presidió al club en 4 periodos distintos entre 1913 y 1951. En el Erlebniswelt del Bayern pueden conocer a fondo la historia de todos nuestros presidentes.
| NOMBRE | PERIODO |
| Franz John | 1900 – 1903 |
| Dr. Willem Hesselink | 1903 – 1906 |
| Dr. Kurt Müller | 1906 – 1907 |
| Dr. Angelo Knorr | 1907 – 1913 |
| Kurt Landauer | 1913 – 1914 |
| Fred Dunn | 1914 – 1915 |
| Hans Tusch | 1915 |
| Fritz Meier | 1915 |
| Hans Bermühler | 1915 |
| Fritz Meier | 1916 – 1919 |
| Kurt Landauer | 1919 – 1921 |
| Fred Dunn | 1921 – 1922 |
| Kurt Landauer | 1922 – 1933 |
| Siegfried Herrmann | 1933 – 1934 |
| Dr. Karl-Heinz Oettinger | 1934 – 1935 |
| Dr. Richard Amesmeier | 1935 – 1937 |
| Franz Nußhardt | 1937 – 1938 |
| Dr. Franz Kellner | 1938 – 1943 |
| Josef Sauter | 1943 – 1945 |
| Franz Xaver Heilmannseder | 1945 |
| Josef Bayer | 1945 |
| Siegfried Herrmann | 1945 – 1947 |
| Kurt Landauer | 1947 – 1951 |
| Julius Scheuring | 1951 – 1953 |
| Adolf Fischer, Karli Wild und Hugo Theisinger | 1953 – 1955 |
| Alfred Reitlinger | 1955 – 1958 |
| Roland Endler | 1958 – 1962 |
| Wilhelm Neudecker | 1962 – 1979 |
| Willi O. Hoffmann | 1979 – 1985 |
| Prof. Dr. Fritz Scherer | 1985 – 1994 |
| Franz Beckenbauer | 1994 – 2009 |
| Uli Hoeneß | 2009 – 2014 |
| Karl Hopfner | 2014 – |